Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gja3Q64448 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gja3Q64448 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gja3Q64448 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja3Q64448 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Gja3Q64448 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gja3Q64448 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja3Q64448 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja3Q64448 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja3Q64448 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja3Q64448 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gja3Q64448 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gja3Q64448 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Gja3Q64448 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Gja3Q64448 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gja3Q64448 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gja3Q64448 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gja3Q64448 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gja3Q64448 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms