Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Surf4Q64310 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Surf4Q64310 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Surf4Q64310 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Surf4Q64310 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Surf4Q64310 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms