Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt12Q64291 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt12Q64291 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt12Q64291 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt12Q64291 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt12Q64291 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt12Q64291 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt12Q64291 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt12Q64291 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt12Q64291 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt12Q64291 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt12Q64291 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt12Q64291 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt12Q64291 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt12Q64291 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt12Q64291 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt12Q64291 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.2 ms