Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PatjQ63ZW7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PatjQ63ZW7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PatjQ63ZW7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PatjQ63ZW7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PatjQ63ZW7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms