Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20854Q62461 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20854Q62461 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20854Q62461 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms