Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Epha6Q62413 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epha6Q62413 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Epha6Q62413 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha6Q62413 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha6Q62413 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha6Q62413 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Epha6Q62413 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha6Q62413 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha6Q62413 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha6Q62413 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Epha6Q62413 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha6Q62413 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Epha6Q62413 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Epha6Q62413 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha6Q62413 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha6Q62413 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha6Q62413 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Epha6Q62413 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha6Q62413 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha6Q62413 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha6Q62413 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha6Q62413 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha6Q62413 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha6Q62413 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms