Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six3Q62233 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six3Q62233 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six3Q62233 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six3Q62233 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Six3Q62233 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six3Q62233 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Six3Q62233 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Six3Q62233 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six3Q62233 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six3Q62233 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six3Q62233 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six3Q62233 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six3Q62233 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six3Q62233 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Six3Q62233 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six3Q62233 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Six3Q62233 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Six3Q62233 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Six3Q62233 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Six3Q62233 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Six3Q62233 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Six3Q62233 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Six3Q62233 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Six3Q62233 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Six3Q62233 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Six3Q62233 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Six3Q62233 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Six3Q62233 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Six3Q62233 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Six3Q62233 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Six3Q62233 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Six3Q62233 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Six3Q62233 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Six3Q62233 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Six3Q62233 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Six3Q62233 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms