Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six1Q62231 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six1Q62231 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six1Q62231 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six1Q62231 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six1Q62231 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six1Q62231 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six1Q62231 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Six1Q62231 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Six1Q62231 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Six1Q62231 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Six1Q62231 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Six1Q62231 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six1Q62231 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Six1Q62231 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms