Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpaQ62189 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpaQ62189 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnrpaQ62189 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpaQ62189 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpaQ62189 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnrpaQ62189 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrpaQ62189 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrpaQ62189 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SnrpaQ62189 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrpaQ62189 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrpaQ62189 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnrpaQ62189 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnrpaQ62189 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrpaQ62189 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrpaQ62189 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrpaQ62189 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrpaQ62189 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrpaQ62189 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpaQ62189 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpaQ62189 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpaQ62189 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpaQ62189 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrpaQ62189 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SnrpaQ62189 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnrpaQ62189 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrpaQ62189 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrpaQ62189 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrpaQ62189 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnrpaQ62189 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrpaQ62189 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrpaQ62189 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnrpaQ62189 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpaQ62189 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpaQ62189 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpaQ62189 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SnrpaQ62189 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms