Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sema4bQ62179 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema4bQ62179 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sema4bQ62179 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema4bQ62179 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms