Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ctr9Q62018 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ctr9Q62018 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ctr9Q62018 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ctr9Q62018 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ctr9Q62018 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms