Protein–RNA interactions for Protein: Q61549

Adgre1, Adhesion G protein-coupled receptor E1, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adgre1Q61549 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Adgre1Q61549 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Adgre1Q61549 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Adgre1Q61549 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Adgre1Q61549 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Adgre1Q61549 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Adgre1Q61549 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Adgre1Q61549 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Adgre1Q61549 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Adgre1Q61549 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Adgre1Q61549 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Adgre1Q61549 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Adgre1Q61549 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Adgre1Q61549 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Adgre1Q61549 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Adgre1Q61549 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Adgre1Q61549 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Adgre1Q61549 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Adgre1Q61549 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Adgre1Q61549 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Adgre1Q61549 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Adgre1Q61549 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms