Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Ccne1Q61457 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccne1Q61457 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccne1Q61457 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccne1Q61457 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccne1Q61457 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccne1Q61457 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccne1Q61457 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccne1Q61457 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccne1Q61457 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccne1Q61457 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccne1Q61457 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccne1Q61457 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccne1Q61457 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ccne1Q61457 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccne1Q61457 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccne1Q61457 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccne1Q61457 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccne1Q61457 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccne1Q61457 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccne1Q61457 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccne1Q61457 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccne1Q61457 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccne1Q61457 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccne1Q61457 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ccne1Q61457 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccne1Q61457 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccne1Q61457 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms