Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna1eQ61290 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna1eQ61290 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacna1eQ61290 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacna1eQ61290 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacna1eQ61290 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna1eQ61290 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms