Protein–RNA interactions for Protein: Q61035

Hars, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HarsQ61035 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HarsQ61035 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HarsQ61035 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HarsQ61035 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HarsQ61035 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HarsQ61035 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HarsQ61035 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HarsQ61035 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HarsQ61035 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HarsQ61035 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HarsQ61035 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HarsQ61035 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HarsQ61035 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms