Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbbp4Q60972 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp4Q60972 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbbp4Q60972 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp4Q60972 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp4Q60972 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms