Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpn1lQ5XFR0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpn1lQ5XFR0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.6 ms