Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
NacadQ5SWP3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC45.67■■■■■ 4.9
NacadQ5SWP3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.65■■■■■ 4.9
NacadQ5SWP3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC45.64■■■■■ 4.9
NacadQ5SWP3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC45.64■■■■■ 4.9
NacadQ5SWP3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.9
NacadQ5SWP3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
NacadQ5SWP3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.9
NacadQ5SWP3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
NacadQ5SWP3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
NacadQ5SWP3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
NacadQ5SWP3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
NacadQ5SWP3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
NacadQ5SWP3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
NacadQ5SWP3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
NacadQ5SWP3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC45.57■■■■■ 4.88
NacadQ5SWP3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
NacadQ5SWP3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
NacadQ5SWP3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
NacadQ5SWP3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
NacadQ5SWP3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
NacadQ5SWP3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
NacadQ5SWP3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC45.53■■■■■ 4.88
NacadQ5SWP3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.53■■■■■ 4.88
NacadQ5SWP3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
NacadQ5SWP3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.88
NacadQ5SWP3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
NacadQ5SWP3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
NacadQ5SWP3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
NacadQ5SWP3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
NacadQ5SWP3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
NacadQ5SWP3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
NacadQ5SWP3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
NacadQ5SWP3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC45.45■■■■■ 4.87
NacadQ5SWP3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
NacadQ5SWP3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
NacadQ5SWP3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
NacadQ5SWP3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
NacadQ5SWP3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
NacadQ5SWP3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.86
NacadQ5SWP3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
NacadQ5SWP3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
NacadQ5SWP3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
NacadQ5SWP3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
NacadQ5SWP3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
NacadQ5SWP3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
NacadQ5SWP3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC45.34■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
NacadQ5SWP3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
NacadQ5SWP3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
NacadQ5SWP3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
NacadQ5SWP3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
NacadQ5SWP3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC45.27■■■■■ 4.84
NacadQ5SWP3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NacadQ5SWP3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NacadQ5SWP3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC45.27■■■■■ 4.84
NacadQ5SWP3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
NacadQ5SWP3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
NacadQ5SWP3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC45.26■■■■■ 4.84
NacadQ5SWP3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC45.24■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC45.2■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC45.2■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.83
NacadQ5SWP3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
NacadQ5SWP3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
NacadQ5SWP3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC45.17■■■■■ 4.82
NacadQ5SWP3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
NacadQ5SWP3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
NacadQ5SWP3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
NacadQ5SWP3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
NacadQ5SWP3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
NacadQ5SWP3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
NacadQ5SWP3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
NacadQ5SWP3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
NacadQ5SWP3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
NacadQ5SWP3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
NacadQ5SWP3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
NacadQ5SWP3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
NacadQ5SWP3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
NacadQ5SWP3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms