Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ankrd40Q5SUE8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ankrd40Q5SUE8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ankrd40Q5SUE8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ankrd40Q5SUE8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ankrd40Q5SUE8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ankrd40Q5SUE8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms