Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bbs12Q5SUD9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bbs12Q5SUD9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bbs12Q5SUD9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bbs12Q5SUD9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms