Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sft2d1Q5SSN7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sft2d1Q5SSN7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms