Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna2d4Q5RJF7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna2d4Q5RJF7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna2d4Q5RJF7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna2d4Q5RJF7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms