Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp22Q5DU02 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp22Q5DU02 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp22Q5DU02 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp22Q5DU02 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms