Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syce1lQ5D525 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syce1lQ5D525 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syce1lQ5D525 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce1lQ5D525 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syce1lQ5D525 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Syce1lQ5D525 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syce1lQ5D525 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms