Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmtc2Q56A06 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmtc2Q56A06 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmtc2Q56A06 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmtc2Q56A06 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmtc2Q56A06 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms