Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CenpjQ569L8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CenpjQ569L8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CenpjQ569L8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CenpjQ569L8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CenpjQ569L8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CenpjQ569L8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CenpjQ569L8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CenpjQ569L8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CenpjQ569L8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CenpjQ569L8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CenpjQ569L8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CenpjQ569L8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CenpjQ569L8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CenpjQ569L8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CenpjQ569L8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CenpjQ569L8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CenpjQ569L8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CenpjQ569L8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CenpjQ569L8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms