Protein–RNA interactions for Protein: Q50H33

Kctd8, BTB/POZ domain-containing protein KCTD8, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd8Q50H33 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd8Q50H33 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd8Q50H33 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd8Q50H33 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd8Q50H33 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd8Q50H33 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd8Q50H33 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd8Q50H33 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd8Q50H33 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd8Q50H33 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd8Q50H33 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd8Q50H33 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms