Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD9

Nxf3, Nuclear RNA export factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf3Q4ZGD9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nxf3Q4ZGD9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nxf3Q4ZGD9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nxf3Q4ZGD9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nxf3Q4ZGD9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nxf3Q4ZGD9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms