Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhox3aQ4TU90 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox3aQ4TU90 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rhox3aQ4TU90 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhox3aQ4TU90 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms