Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a5Q4LDG0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc27a5Q4LDG0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc27a5Q4LDG0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a5Q4LDG0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms