Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp235Q499D5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp235Q499D5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp235Q499D5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp235Q499D5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfp235Q499D5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms