Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itga1Q3V3R4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Itga1Q3V3R4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga1Q3V3R4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga1Q3V3R4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itga1Q3V3R4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga1Q3V3R4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms