Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd53Q3V0J4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd53Q3V0J4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd53Q3V0J4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd53Q3V0J4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd53Q3V0J4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms