Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY34

Uncharacterized protein C12orf43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UY34 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3UY34 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3UY34 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UY34 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UY34 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UY34 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3UY34 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3UY34 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UY34 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UY34 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UY34 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UY34 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UY34 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UY34 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UY34 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3UY34 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3UY34 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3UY34 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3UY34 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3UY34 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3UY34 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3UY34 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UY34 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UY34 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UY34 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UY34 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3UY34 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3UY34 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3UY34 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UY34 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UY34 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3UY34 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UY34 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UY34 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UY34 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3UY34 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UY34 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UY34 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UY34 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3UY34 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UY34 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UY34 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3UY34 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UY34 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UY34 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3UY34 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UY34 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UY34 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3UY34 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UY34 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UY34 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3UY34 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3UY34 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3UY34 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3UY34 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3UY34 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3UY34 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3UY34 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3UY34 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3UY34 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3UY34 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3UY34 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3UY34 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3UY34 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3UY34 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3UY34 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3UY34 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3UY34 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3UY34 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3UY34 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3UY34 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3UY34 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3UY34 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3UY34 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3UY34 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3UY34 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3UY34 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3UY34 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3UY34 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3UY34 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3UY34 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3UY34 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3UY34 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UY34 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UY34 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UY34 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UY34 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UY34 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3UY34 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UY34 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UY34 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UY34 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UY34 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UY34 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UY34 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3UY34 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3UY34 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3UY34 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3UY34 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3UY34 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms