Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrc4Q3UP24 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrc4Q3UP24 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrc4Q3UP24 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrc4Q3UP24 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrc4Q3UP24 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms