Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp30Q3UN04 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp30Q3UN04 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp30Q3UN04 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp30Q3UN04 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp30Q3UN04 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp30Q3UN04 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp30Q3UN04 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp30Q3UN04 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms