Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdgfl2Q3UMU9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hdgfl2Q3UMU9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdgfl2Q3UMU9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms