Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Lmod2Q3UHZ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Lmod2Q3UHZ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Lmod2Q3UHZ5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lmod2Q3UHZ5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lmod2Q3UHZ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Lmod2Q3UHZ5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lmod2Q3UHZ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Lmod2Q3UHZ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lmod2Q3UHZ5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Lmod2Q3UHZ5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Lmod2Q3UHZ5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Lmod2Q3UHZ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Lmod2Q3UHZ5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lmod2Q3UHZ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Lmod2Q3UHZ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lmod2Q3UHZ5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Lmod2Q3UHZ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Lmod2Q3UHZ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Lmod2Q3UHZ5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Lmod2Q3UHZ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Lmod2Q3UHZ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms