Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx27Q3UHD6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx27Q3UHD6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx27Q3UHD6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx27Q3UHD6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx27Q3UHD6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx27Q3UHD6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms