Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rrp36Q3UFY0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp36Q3UFY0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp36Q3UFY0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp36Q3UFY0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrp36Q3UFY0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp36Q3UFY0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrp36Q3UFY0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrp36Q3UFY0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms