Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slc10a4Q3UEZ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slc10a4Q3UEZ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc10a4Q3UEZ8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc10a4Q3UEZ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc10a4Q3UEZ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc10a4Q3UEZ8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms