Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5Q7

Cmpk2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk2Q3U5Q7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cmpk2Q3U5Q7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cmpk2Q3U5Q7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmpk2Q3U5Q7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmpk2Q3U5Q7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmpk2Q3U5Q7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms