Protein–RNA interactions for Protein: Q3U492

Kcp, Kielin/chordin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KcpQ3U492 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24,28■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24,28■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,27■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
KcpQ3U492 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24,26■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,23■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
KcpQ3U492 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,2■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24,2■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24,2■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24,17■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24,16■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24,15■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
KcpQ3U492 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24,12■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24,1■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24,1■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24,1■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24,09■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
KcpQ3U492 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24,08■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24,06■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24,02■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24,02■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,02■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
KcpQ3U492 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,3 ms