Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CenplQ3U3S3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CenplQ3U3S3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenplQ3U3S3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CenplQ3U3S3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenplQ3U3S3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms