Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ulk3Q3U3Q1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ulk3Q3U3Q1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ulk3Q3U3Q1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ulk3Q3U3Q1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 530.6 ms