Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm4dQ3U2K5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kdm4dQ3U2K5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm4dQ3U2K5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4dQ3U2K5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm4dQ3U2K5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4dQ3U2K5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4dQ3U2K5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms