Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LcorlQ3U285 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LcorlQ3U285 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LcorlQ3U285 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LcorlQ3U285 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LcorlQ3U285 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LcorlQ3U285 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LcorlQ3U285 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LcorlQ3U285 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LcorlQ3U285 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LcorlQ3U285 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LcorlQ3U285 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms