Protein–RNA interactions for Protein: Q3U128

Apcdd1, Protein APCDD1, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apcdd1Q3U128 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apcdd1Q3U128 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apcdd1Q3U128 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apcdd1Q3U128 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apcdd1Q3U128 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apcdd1Q3U128 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Apcdd1Q3U128 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apcdd1Q3U128 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apcdd1Q3U128 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apcdd1Q3U128 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apcdd1Q3U128 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apcdd1Q3U128 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apcdd1Q3U128 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms