Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Palb2Q3U0P1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Palb2Q3U0P1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Palb2Q3U0P1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Palb2Q3U0P1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Palb2Q3U0P1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Palb2Q3U0P1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms