Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tbc1d2bQ3U0J8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tbc1d2bQ3U0J8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms